Para ilmuwan telah merekonstruksi genom dari endure bermuka pendek masif punah ( Arctodus simus ) dan endure naungan Amerika ( ) Ursus americanus ) memanfaatkan fragmen DNA lingkungan dari jarak jauh Chiquihuite Runtuh Meksiko.

Reconstruction of the giant, short-faced North American bear Arctodus simus. Image credit: Daniel Reed / CC BY-SA 3.0.

Rekonstruksi yang sangat besar, berwajah pendek Amerika Utara bertahan Arctodus simus . Kredit gambar: Daniel Reed / CC BY-SA 3.0.

Berkas fosil tidak lengkap, dan memuat spesies mamalia, di eksplisit spesies yang hidup dengan kepadatan penduduk rendah, jarang dipelajari.

Untuk spesies basi ini, ekstraksi DNA yang tidak bersahabat dari sisa-sisa fosil memiliki kemampuan untuk meningkatkan wawasan terkini perihal penghuni dan sejarah evolusi ; sebagai alternatif, ini juga menyebabkan rasa sakit yang tidak dapat disembuhkan pada spesimen yang harganya terlalu mahal.

Inovasi bahwa DNA dari populasi organisme sebelumnya juga dapat dengan baik dibeli eksklusif dari sedimen, oleh karena itu, menjanjikan cita-cita yang sangat besar. untuk genetika dan filogenetik penghuni basi.

Secara total penelitian dinamai DNA lingkungan (eDNA), maksud ini bergantung pada sekuensing fragmen DNA yang berasal dari sel-sel yang terlepas, rambut, feses, dan urin sedimen internal yang diawetkan.

Cara eDNA lama yang sama memungkinkan komposisi spesies dipastikan dalam ketiadaan makrofosil semua oleh keragaman lingkungan di sisi sedimen, gugusan gua, inti es, danau, sungai, dan samudra.

Untuk tingkat ini, sebagai alternatif, analisis eDNA basi telah dibatasi pada DNA mitokondria dan kloroplas atau, lebih hanya dalam waktu dekat sebelumnya, menjadi pendek dan sangat beragam urutan yang dihasilkan menggunakan tujuan pengurutan senapan.

“Saat seekor binatang atau a insan buang air kecil atau buang air besar, sel-sel dari organisme juga dikeluarkan. Dan fragmen DNA dari sel-sel ini ialah yang dapat kami deteksi di dalam sampel tanah, ”kata Profesor Eske Willerslev, peneliti di Departemen Zoologi di College of Cambridge dan Lundbeck Foundation GeoGenetics Center di College of Copenhagen.

“Penggunaan cara pengurutan yang sangat efektif, kami merekonstruksi genom – profil genetik – pada dasarnya berdasarkan sepenuhnya pada fragmen ini untuk pertama kalinya.”

“Sekarang kami telah menawarkan bahwa rambut, air seni dan kotoran semuanya menyediakan kain genetik yang, dalam kondisi yang sebenarnya, dapat terus ada selama lebih dari 10.000 tahun.”

Dalam kelonggaran, Profesor Willerslev dan rekan-rekannya mengambil file genom-besar basi dari 16.000 sampai 14.000 tahun sedimen basi di Chiquihuite Runtuh Pegunungan Astillero, Meksiko.

Penaksiran mereka menawarkan bahwa Pleistosen Akhir teduh penduduk bertahan hidup di Meksiko secara nenek moyang terkait dengan tingkatHari ini penduduk Amerika Timur yang teduh bertahan hidup, dan bahwa beruang berwajah pendek besar yang telah punah di Meksiko sangat berbeda dari penduduk Beringian yang lebih awal.

“Berwajah pendek Beruang yang hidup di Meksiko utara memiliki perbedaan yang terang dari penghuni beruang teduh yang tinggal di barat laut Kanada, ”kata Dr. Mikkel Winther Pedersen, seorang peneliti di Lundbeck Foundation GeoGenetics Center di GLOBE Institute di College of Copenhagen.

“Berikut ialah contoh rupawan dari file terbaru yang masing-masing dalam sekejap dapat diakses bahkan ketika Anda merekonstruksi genom pada dasarnya berdasarkan sepenuhnya pada fragmen eDNA yang diekstraksi dari tanah.”

“Di setiap kawasan di dunia, semua orang yang secara ilmiah hidup di ambang DNA basi menyadari perlunya merekonstruksi genom dari tingkat fragmen ke dalam tanah atau sedimen,” Profesor Willerslev mengakui .

“Memiliki Kemampuan untuk melakukan itu untuk pertama kalinya niat yang kita miliki sekarang membuka batas baru. “

” Analisis tingkat DNA di dalam tanah juga dapat memiliki kemampuan untuk memperkuat cerita perihal semua bagian dari evolusi spesies sampai perkembangan cuaca asli secara bergantian – di sini ialah pendaratan genomik di bulan karena fosil tidak akan diinginkan. ”

Makalah yang menjelaskan penelitian diubah menjadi dicetak dalam jurnal Hayati Pada masa ini .

_____

Mikkel Winther Pedersen dkk . Genomik lingkungan dari beruang teduh Pleistosen Akhir dan beruang besar berwajah pendek. Hayati Pada masa ini , dicetak on-line 19 April 2021; doi: 10.1016 / j.cub.2021.04.027

Read More